Kırgızistan – Türkiye Manas Üniversitesi bünyesinde yüksek lisans programları 2001 yılında açılmıştır. İşletme yüksek lisans programı (580200), Üniversite bünyesinde ilk açılan programlardan birisidir.

İşletme yüksek lisans programına öğrenci kabulü yılda bir kez yapılmaktadır. Programın öğrenci kontenjanı yıllar itibari ile değişmek ile birlikte 6 ile 10 arasındadır. Tam zamanlı olarak eğitim verilen yüksek lisans programında başarılı öğrencilerin burs imkanı bulunmaktadır.

Ayrıca yüksek öğrencileri Mevlana, Orhun ve Erasmus+ gibi öğrenci değişim programlarından da istifade edebilmektedir.

İşletme yüksek lisans programı ilk mezunlarını 2004 yılında vermiştir. Bugüne kadar toplam 57 yüksek lisans öğrencisi programdan mezun olmuştur.

İşletme yüksek lisans programının içeriği Kırgız Eğitim ve Bilim Bakanlığı standardına göre piyasa ve diğer paydaşların talepleri göz önüne alınarak oluşturulmuştur.

İşletme Anabilim Dalı KTMÜ Sosyal Bilimler Enstitüsü bünyesinde yer almaktadır ve “580200 Yönetim” kapsamında yüksek lisans öğrencileri yetiştirilmektedir.